东汉永寿三年（公元157年），桓帝重修孔墓，并在墓前建造了一间神门，在东南方向建造了一间斋宿。
司马迁在《史记》中曾写有孔子冢大一顷，经考证，当时的茔地占地约百亩。
南北朝时，孔林内植树600株。
宋宣和年间，孔子墓前修造了石仪。
元文宗至顺二年（公元1331年），孔子后裔孔思凯修建了林墙，构筑了林门。
大约在明代晚期，茔地已经扩大到1800余亩。
康熙二十三年（1684年），清圣祖来曲阜祭孔，允准再次增扩林地11419亩。
此后又重修了各种门坊，并有专官守卫，孔林的规模基本延续至今。
据统计，自汉开始至今，孔林共重修、增修了13次，增植树木5次，扩充林地孔林（局部）3次，总占地达到了29419亩。
如今的孔林内有柏、榆、槐、桧、朴、枫、杨、柳、柞、楷、女贞、五味、檀雒离、樱花和野菊、半夏、柴胡、太子参、灵芝等数百种植物，有些树株人们至今叫不出它们的名字，因此，人们将孔林称作天然的植物园。
在这个天然的植物园里，有一条长达1000余米神道，由桧柏夹侍，平直如矢。
神道的尽头是木制的至圣林牌坊，也就是孔林的大门，大门内是一个相对封闭的纵深空间，有众多挺拔的桧柏。
通过一条狭长的甫道便可以来到二林门，也叫观楼，为城堡式建筑，四周的墙壁高约4米，周长达7000余米。
在墙内有一条小河，名叫洙水河，通过河面上的洙水桥，沿轴线往北走，登墓门，穿甬道，便是享殿。
享殿是专门祭孔时摆放香坛的地方，殿前摆放着翁仲、望柱、文豹、角端等石兽；殿后正中的大墓就是孔子的坟地，墓前有明朝黄养正篆书大成至圣文宣王墓巨碑。
东边是其子泗水侯孔鲤的墓穴；前边是其孙沂国述圣公孔子思的墓地，之所以这样安排墓穴，是因为这种布局为携子抱孙。
孔子墓前的东侧建有三座小亭，分别为宋真宗、清圣祖和清高宗来此祭孔时修建的，起名为驻跸亭。
在孔林中，除了孔子的墓穴外，气派较大、墓饰规格较高的要数孔子第七十二代孙孔宪培妻子的墓——于氏坊。
于氏夫人原本是乾隆皇帝的女儿，由于当时满汉不能通婚，皇帝便将女儿过继给当时的一品大员于敏中，然后以于敏中女儿的名义下嫁给衍圣公，于氏夫人去世后，其后人便为其修建了规模高于孔子后人的于氏坊。
断碑深树里，无路可寻看。
在万木掩映的孔林中，墓冢累累，碑石如林，石仪成群，包含了宋、金、元、明、清、民国等几个时代的墓碑和谒陵题记刻石等4000余块，宋、明、清时期的石人、石狮、石马、石羊、供桌、望柱和神道坊等石仪千余件。
此外还有门、坊、碑亭、享殿等60余座明清建筑。
因此，孔林作为家族墓地，在世界上是没有先例的，对于研究我国的墓葬制度，研究我国古代政治、经济、风俗、文化、艺术、书法等都有很高的价值。
1961年，国务院将孔林列为第一批国家重点文物保护单位。
第二节邹县三孟：孟府、孟庙、孟林邹城原名邹县，位于山东省南部，有着3000多年的悠久历史，是我国古代伟大思想家、教育家孟子的诞生地，很早就有邹鲁之称。
孟子，字轲，战国时期伟大的思想家、儒家的主要代表之一、鲁国贵族孟孙氏的后裔，约生于公元前372年，于公元前289年去世。
孟子生前主张仁政，被后人称为亚圣。